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Novo Genomics
La startup sanitaria Novo Genomics sta gettando le basi per una medicina personalizzata in Arabia Saudita, con un sequenziamento all'avanguardia che utilizza l'architettura Lenovo Genomics Optimization And Scalability Tool (GOAST) basata su server Lenovo ThinkSystem SR630 V2, alimentati da Processori scalabili Intel® Xeon®, e array di storage unificati Lenovo ThinkSystem serie DM.
“Dopo un'approfondita valutazione del mercato, abbiamo stabilito che Lenovo GOAST era la soluzione ideale per le nostre esigenze. Scegliendo una soluzione HPC già pronta, progettata appositamente per la genomica e la bioinformatica, abbiamo evitato i costi significativi e la complessità legati alla progettazione e alla costruzione del nostro cluster".
Abdulrahman Alasiri
Direttore Informatica Biomedica, Novo Genomics
A partire dalla fine degli anni 2000, le tecnologie NGS hanno ridotto drasticamente i costi e i tempi del sequenziamento del DNA. I progressi nella tecnologia del calcolo ad elevate prestazioni (HPC) comportano la possibilità di eseguire il sequenziamento genomico di intere popolazioni.
Tuttavia, la gestione dell’enorme volume e velocità dei dati, che varia da 10 a 300 GB per campione, presenta ancora sfide tecniche impegnative. I ricercatori devono filtrare i dati grezzi più volte per renderli utilizzabili per l'analisi clinica successiva, un processo impegnativo e che necessita di molte risorse.
Abdulrahman Alasiri, Direttore di Informatica Biomedica presso Novo Genomics, spiega: “Il nostro obiettivo finale è quello di poter offrire a ogni cittadino del Regno l'accesso a cure mediche personalizzate basate sui propri geni. In passato, nel Paese non esisteva alcuna struttura in grado di eseguire analisi genomiche di questa portata. Trattandosi di una startup snella, il nostro obiettivo era di implementare un’infrastruttura HPC che ci consentisse di portare per la prima volta le più recenti tecniche di sequenziamento in Arabia Saudita”.
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