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La investigación se acelera con la informática de alto rendimiento en la nube.

La infraestructura en la nube de Lenovo, con procesadores Intel® Xeon® Platinum, facilita la colaboración y nuevos tipos de proyectos de investigación para mantener las cargas de trabajo de IA y HPC en la Universidad de Victoria.

Soluciones de infraestructura de Lenovo

para arquitecturas basadas en datos

La investigación se acelera con la informática de alto rendimiento en la nube.

La infraestructura en la nube de Lenovo, con procesadores Intel® Xeon® Platinum, facilita la colaboración y nuevos tipos de proyectos de investigación para mantener las cargas de trabajo de IA y HPC en la Universidad de Victoria.

Soluciones de infraestructura de Lenovo

para arquitecturas basadas en datos

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Contexto

La Universidad de Victoria (UVic) es una de las principales universidades de investigación de Canadá. Su campus en la isla de Vancouver alberga a más de 22000 estudiantes y a cientos de investigadores, así como algunos de los principales institutos de investigación del país.

Un centro de datos de informática de investigación avanzada (ARC) de Compute Canada en el campus proporciona servicios e infraestructura de informática de alto rendimiento (HPC) no solo a los equipos de investigación de la propia universidad, sino también a otras instituciones en Canadá y en todo el mundo. Los proyectos de investigación que respalda el centro son sobre el aprendizaje automático en línea, el análisis de big data y la informática colaborativa.

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Reto

El departamento de IT de la UVic creó originalmente la infraestructura Arbutus OpenStack para proporcionar los servicios que necesitaban sus investigadores: plataformas colaborativas de alta disponibilidad, sitios web personalizados, acceso raíz, entornos de microservicios y otros servicios de informática en la nube. Su implementación inicial podía admitir miles de máquinas virtuales, cada una de las cuales podía configurarse para las necesidades exactas de los proyectos de investigación individuales. El proyecto tuvo tanto éxito que su popularidad creció. Durante cuatro años, muchos más equipos y proyectos comenzaron a utilizar el almacenamiento, la memoria y los recursos informáticos avanzados de Arbutus. La UVic decidió ampliar la infraestructura para que pudieran beneficiarse más investigadores.

Los servicios de IT que teníamos no contaban con la infraestructura necesaria para dar respuesta a algunas de las necesidades informáticas avanzadas de nuestros investigadores. Teníamos clústeres de HPC, pero los investigadores necesitaban con urgencia plataformas colaborativas de alta disponibilidad, sitios web personalizados, acceso raíz, entornos de microservicios y otros servicios de informática en la nube.

Belaid Moa Doctor, especialista en informática de investigación avanzada, Universidad de Victoria

Más capacidad informática para apoyar a más investigadores y proyectos

Como ordenador líder en la lista de los superordenadores más rápidos TOP500, Lenovo fue la mejor opción para la nueva infraestructura de servidores de la UVic. La nueva plataforma en la nube Arbutus proporciona capacidades de procesamiento de datos con mayor rendimiento, con una capacidad de memoria mucho mayor por nodo. Como resultado, la UVic puede gestionar muchas más máquinas virtuales por servidor, lo que significa que puede respaldar a más investigadores y proyectos que nunca.

Un servicio imprescindible para muchos investigadores

La implementación más reciente de la Universidad de Victoria, Arbutus Phase 2, incorpora 208 nodos de Lenovo ThinkSystem SR630, SR670 y SD530, y casi 8000 núcleos más al clúster, con procesadores Intel® Xeon® escalables. Cada nodo cuenta con un promedio de 119 GB de memoria TruDDR4 del Lenovo ThinkSystem más 1 TB de memoria persistente Intel® Optane™.

La nueva infraestructura permite que la plataforma en la nube Arbutus de segunda generación ofrezca capacidades de procesamiento de datos con mayor rendimiento, con una capacidad de memoria mucho mayor por nodo. Como resultado, la UVic puede gestionar muchas más máquinas virtuales por servidor, lo que significa que puede respaldar a más investigadores y proyectos que nunca.

La plataforma ahora está bien equipada para admitir cargas de trabajo de inteligencia artificial y aprendizaje automático, lo que permite a los investigadores compilar fácilmente su código de inteligencia artificial y aprendizaje automático.

La plataforma Arbutus, con las innovadoras tecnologías de Intel y Lenovo, se ha vuelto tan importante como los clústeres de HPC y un servicio de ARC esencial para muchos investigadores.

Belaid Moa Doctor, especialista en informática de investigación avanzada, Universidad de Victoria

La mayoría de mis proyectos en los últimos 15 años han girado en torno al estudio de la interacción de las moléculas con las superficies. Por ejemplo, mi equipo estudia cómo las proteínas del cuerpo humano interactúan con plásticos, como catéteres, estents, suturas y órganos artificiales, para intentar llegar a la base molecular de la biocompatibilidad.

Dennis K. Hore Doctor, profesor de Química e Informática, Universidad de Victoria
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Resultados

Además de admitir una cantidad mucho mayor de proyectos, Arbutus Phase 2 proporciona una gama más completa y flexible de servicios en la nube. Y los equipos de investigación pueden aumentar más rápidamente porque pueden crear sus propios laboratorios virtuales mucho más rápidamente. Muchos trabajos de inteligencia artificial y aprendizaje automático ahora se pueden ejecutar en paralelo en clústeres de nodos más pequeños durante períodos más prolongados, lo que reduce el tiempo de espera de una ventana en un clúster más grande.

Y, lo que es más importante, más equipos de investigación pueden utilizar la nueva capacidad informática de la UVic para contribuir positivamente a la sociedad e, incluso, salvar vidas. Por ejemplo, Dennis K. Hore, doctor, profesor de Química e Informática en la UVic, ha lanzado un proyecto que utiliza big data y el aprendizaje automático para ayudar a mejorar la vida de las personas que toman medicamentos sin receta, al intentar reducir los casos de sobredosis.

El profesor Hore comenta: “Trabajamos de forma anónima con la gente para darle información sobre la composición de los medicamentos que trae voluntariamente para analizarlos. Hacemos muchos análisis químicos de sus muestras con instrumentos analíticos de última generación y usamos esa información, junto con bases de datos y bibliotecas de compuestos químicos, para crear aplicaciones y algoritmos de aprendizaje automático. Uno de los objetivos del programa es aportar información que permita a la gente tomar decisiones fundamentadas sobre el uso de esas sustancias, de acuerdo con su composición y concentración”.

Mejor soporte para cargas de trabajo de inteligencia artificial y aprendizaje automático

Más máquinas virtuales por servidor

Más rapidez al reiniciar el ordenador para reducir el tiempo de inactividad

Cuando un investigador solicita un entorno, lo que consideramos su propio laboratorio virtual, configuramos la red y el hardware para respaldar su trabajo. Luego, puede crear su propio laboratorio virtual en minutos, con o sin la ayuda de nuestros servicios. Algunos laboratorios virtuales incluso ejecutan cargas de trabajo de HPC a pequeña escala, como GROMACS, el software de dinámica molecular para estudiar, entre otras cosas, el virus SARS-CoV-2.

Belaid Moa Doctor, especialista en informática de investigación avanzada

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