een medewerker met een bouwkraan op de achtergrond

Versnel je onderzoek met high-performance computing in de cloud.

De Lenovo-cloudinfrastructuur met de kracht van Intel® Xeon® Platinum-processors maakt de ondersteuning van AI- en HPC-workloads mogelijk bij samenwerking en nieuwe soorten onderzoeksprojecten aan de universiteit van Victoria.

Lenovo Infrastructure Solutions

voor de Data-centered

Versnel je onderzoek met high-performance computing in de cloud.

De Lenovo-cloudinfrastructuur met de kracht van Intel® Xeon® Platinum-processors maakt de ondersteuning van AI- en HPC-workloads mogelijk bij samenwerking en nieuwe soorten onderzoeksprojecten aan de universiteit van Victoria.

Lenovo Infrastructure Solutions

voor de Data-centered

1

Achtergrond

De universiteit van Victoria (UVic) is een van de toonaangevende onderzoeksuniversiteiten van Canada. De campus op Vancouver Island biedt onderdak aan meer dan 22.000 studenten en honderden onderzoekers, en ook aan enkele van de toonaangevende onderzoeksinstituten van het land.

Het ARC-datacenter (Advanced Research Computing) van Compute Canada op de campus beschikt over een HPC-infrastructuur die niet alleen wordt gebruikt door onderzoeksteams van de universiteit zelf, maar ook door andere instellingen in Canada en de rest van de wereld. De onderzoeksprojecten waarvoor het datacenter wordt gebruikt, richten zich op online machine learning, big data-analyse en collaborative computing.

2

Uitdaging

De IT-afdeling van UVic heeft de Arbutus OpenStack-infrastructuur oorspronkelijk gecreëerd om de services te leveren die hun onderzoekers nodig hadden: samenwerkingsplatforms met hoge beschikbaarheid, aangepaste websites, roottoegang, microserviceomgevingen en andere cloudcomputingservices. De eerste implementatie bood ondersteuning voor duizenden virtuele machines, die allemaal konden worden aangepast aan de exacte vereisten van individuele onderzoeksprojecten. Het project was zo succesvol dat de populariteit ervan groeide. In de vier jaar die volgden, begonnen steeds meer teams en projecten de bronnen voor opslag, geheugen en geavanceerde computing van Arbutus te gebruiken. UVic besloot de infrastructuur uit te breiden, zodat meer onderzoekers ervan konden profiteren.

Onze bestaande IT-services beschikten niet over een infrastructuur die voldeed aan de geavanceerde computingwensen van onze onderzoekers. We hadden HPC-clusters, maar onderzoekers hadden dringend behoefte aan samenwerkingsplatforms met hoge beschikbaarheid, aangepaste websites, roottoegang, microserviceomgevingen en andere cloudcomputingservices.

Belaid Moa Ph.D. Advanced Research Computing Specialist, Universiteit van Victoria

Meer rekenkracht om meer onderzoekers en projecten te ondersteunen

Als grootste speler in de TOP500-lijst met snelste supercomputers, was Lenovo de eerste keuze voor de nieuwe serverinfrastructuur van UVic. Het nieuwe Arbutus-cloudplatform biedt betere prestaties voor gegevensverwerking, met een sterk verhoogde geheugencapaciteit per node. UVic kan hierdoor veel meer virtuele machines per server draaien, en dat betekent dat er meer onderzoekers en meer projecten dan ooit tevoren kunnen worden ondersteund.

Een essentiële service voor veel onderzoekers

Voor Arbutus Phase 2, de nieuwste implementatie aan de universiteit van Victoria, zijn 208 Lenovo ThinkSystem SR630-, SR670- en SD530-nodes en bijna 8000 extra cores toegevoegd aan het cluster met Intel® Xeon® Scalable-processors. Elke node beschikt over gemiddeld 119 GB Lenovo ThinkSystem TruDDR4-geheugen, plus 1 TB Intel® Optane™ persistent geheugen.

De nieuwe infrastructuur van de tweede generatie van het Arbutus-cloudplatform zorgt voor betere prestaties voor gegevensverwerking, met een sterk verhoogde geheugencapaciteit per node. UVic kan hierdoor veel meer virtuele machines per server draaien, en dat betekent dat er meer onderzoekers en meer projecten dan ooit tevoren kunnen worden ondersteund.

Het platform is nu goed uitgerust voor de ondersteuning van AI/ML-workloads, waardoor onderzoekers eenvoudig hun AI/ML-code kunnen compileren.

Het Arbutus-platform is gebaseerd op de allernieuwste Lenovo- en Intel-technologieën en is voor veel onderzoekers net zo belangrijk als HPC-clusters en een essentiële ARC-service geworden.

Belaid Moa Ph.D. Advanced Research Computing Specialist, Universiteit van Victoria

De meeste van mijn projecten van de afgelopen 15 jaar draaiden om het bestuderen van de interactie van moleculen met oppervlakken. Mijn team bestudeert bijvoorbeeld de interactie van eiwitten in het menselijk lichaam met kunststoffen zoals katheters, stents, hechtingen en kunstorganen, in een poging de moleculaire basis van biocompatibiliteit te bereiken.

Dennis K. Hore Ph. D., Professor of Chemistry and Computer Science, Universiteit van Victoria
3

Resultaat

Arbutus Phase 2 biedt niet alleen ondersteuning voor veel meer projecten, het biedt ook toegang tot een uitgebreidere en flexibelere selectie aan cloudservices. Onderzoeksteams kunnen veel sneller opschalen omdat ze eenvoudiger eigen virtuele laboratoria kunnen creëren. Veel AI/ML-taken kunnen nu gedurende langere tijd parallel worden uitgevoerd op kleinere nodeclusters, waardoor de wachttijd voor een venster op een groter cluster wordt beperkt.

Het belangrijkste is dat meer onderzoeksteams de nieuwe rekenkracht van UVic kunnen gebruiken om een positieve bijdrage te leveren aan de samenleving, en zelfs om levens te redden. Dennis K. Hore, Ph. D., Professor of Chemistry and Computer Science aan UVic, heeft bijvoorbeeld een project gelanceerd waarbij big data en machine learning worden gebruikt om het leven te verbeteren van mensen die medicijnen zonder recept gebruiken door te proberen het aantal overdoses te verminderen.

Professor Hore legt uit: "We werken anoniem met mensen om hen te informeren over de samenstelling van medicijnen die ze vrijwillig binnenbrengen voor analyse. We voeren allerlei chemische analyses uit op hun monsters met behulp van ultramoderne analysehulpmiddelen en gebruiken die gegevens samen met chemische bibliotheken en databases om algoritmen en toepassingen voor machine learning te bouwen. Een van de doelen van het programma is om informatie over te brengen die mensen in staat stelt weloverwogen beslissingen te nemen over het gebruik van medicijnen, afhankelijk van de samenstelling en sterkte."

Betere ondersteuning van AI/ML-workloads

Meer virtuele machines per server

Het systeem kan sneller opnieuw worden opgestart, dus er is minder downtime

Als een onderzoeker een omgeving aanvraagt, beschouwen wij dit als hun eigen virtuele laboratorium. Het netwerk en de hardware worden dan geconfigureerd om hun werk te ondersteunen. Ze kunnen dan binnen enkele minuten hun eigen virtuele laboratorium creëren, met of zonder ondersteuning van onze services. In sommige virtuele laboratoria worden zelfs kleinschalige HPC-workloads uitgevoerd. Een voorbeeld hiervan is GROMACS, de software voor moleculaire dynamica die wordt gebruikt voor het bestuderen van zaken als het SARS-CoV-2-virus.

Belaid Moa Ph.D. Advanced Research Computing Specialist

Versnel jouw bedrijfsactiviteiten met slimmere AI- en analysestrategie

Met Lenovo AI & Analytics Solutions krijg je niet alleen een open, bewezen en gebruiksklare technologie. Je krijgt een partner die je helpt bij elke stap.

Ben jij er klaar voor om je aan te sluiten bij de Data-centered?
Maak kennis met onze aanpak en oplossingen.